Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm5478D3Z6R0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms