Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms