Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3676D3Z236 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms