Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf217D3YYI7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms