Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc170D3YXL0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms