Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9230113P08RikD3YWX3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9230113P08RikD3YWX3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
9230113P08RikD3YWX3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
9230113P08RikD3YWX3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
9230113P08RikD3YWX3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms