Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rfx8D3YU81 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rfx8D3YU81 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
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