Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cttnbp2B9EJA2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cttnbp2B9EJA2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms