Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20547B8JJN0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Gm20547B8JJN0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Gm20547B8JJN0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
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Gm20547B8JJN0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Gm20547B8JJN0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Gm20547B8JJN0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Gm20547B8JJN0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Gm20547B8JJN0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gm20547B8JJN0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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