Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Clrn2B2RVW2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms