Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc8B2RUS7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc8B2RUS7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc8B2RUS7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc8B2RUS7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc8B2RUS7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Abcc8B2RUS7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Abcc8B2RUS7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms