Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usf3B2RUQ2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms