Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apba1B2RUJ5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms