Protein–RNA interactions for Protein: B2RQE8

Arhgap42, Rho GTPase-activating protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap42B2RQE8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap42B2RQE8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgap42B2RQE8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arhgap42B2RQE8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arhgap42B2RQE8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms