Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
AU022751B1B0V2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AU022751B1B0V2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms