Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Col4a6B1AVK5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Col4a6B1AVK5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Col4a6B1AVK5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a6B1AVK5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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