Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spocd1B1ASB6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spocd1B1ASB6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms