Protein–RNA interactions for Protein: A6X8I0

Gm1993, Predicted gene 1993, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1993A6X8I0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm1993A6X8I0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm1993A6X8I0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm1993A6X8I0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm1993A6X8I0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm1993A6X8I0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm1993A6X8I0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm1993A6X8I0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm1993A6X8I0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm1993A6X8I0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm1993A6X8I0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm1993A6X8I0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm1993A6X8I0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1993A6X8I0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm1993A6X8I0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms