Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm5640A3KG49 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Gm5640A3KG49 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm5640A3KG49 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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