Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2al1jA2BFR3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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