Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AgrnA2ASQ1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms