Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtf1A2AQ19 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Rtf1A2AQ19 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Rtf1A2AQ19 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Rtf1A2AQ19 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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Rtf1A2AQ19 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtf1A2AQ19 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms