Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syndig1A2ANU3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syndig1A2ANU3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms