Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lcn6A2AJB9 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Lcn6A2AJB9 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lcn6A2AJB9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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