Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramel3A2AHA7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pramel3A2AHA7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms