Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ambra1A2AH22 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ambra1A2AH22 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms