Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ckap5A2AGT5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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