Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rbbp8nlA2ABX0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rbbp8nlA2ABX0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms