Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pramef6A2A8M8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pramef6A2A8M8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms