Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc194A0A140LIT1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc194A0A140LIT1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc194A0A140LIT1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc194A0A140LIT1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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