Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Knop1Q9Z2Q2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Knop1Q9Z2Q2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms