Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krt16Q9Z2K1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krt16Q9Z2K1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms