Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Syngr4Q9Z1L2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Syngr4Q9Z1L2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms