Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Padi3Q9Z184 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Padi3Q9Z184 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms