Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sumo3Q9Z172 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sumo3Q9Z172 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sumo3Q9Z172 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Sumo3Q9Z172 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sumo3Q9Z172 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sumo3Q9Z172 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms