Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnni1Q9WUZ5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnni1Q9WUZ5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms