Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnip1Q9WUU8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnip1Q9WUU8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms