Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Usp18Q9WTV6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Usp18Q9WTV6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms