Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sorbs3Q9R1Z8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms