Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T4

Sept6, Septin-6, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept6Q9R1T4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sept6Q9R1T4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sept6Q9R1T4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sept6Q9R1T4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sept6Q9R1T4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sept6Q9R1T4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept6Q9R1T4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms