Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ntn3Q9R1A3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ntn3Q9R1A3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms