Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Plod1Q9R0E2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plod1Q9R0E2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms