Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Plod3Q9R0E1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Plod3Q9R0E1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms