Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Wdr54Q9R0D8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms