Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AmfrQ9R049 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AmfrQ9R049 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms