Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Phtf1Q9QZ09 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms