Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trp53inp1Q9QXE4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms