Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Limd1Q9QXD8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Limd1Q9QXD8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms