Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc5Q9QX29 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc5Q9QX29 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms