Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Csnk1eQ9JMK2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms